Da die meisten Blog Einträge zu “Putty Konfiguration sichern” ziemlich alt sind:
Unter Windows 7 Start > Ausführen:
regedit /e puttynew.reg HKEY_CURRENT_USER\Software\SimonTatham\PuTTY

Die Datei findet sich dann unter C:\Windows\System32\puttynew.reg
Von dort aus kann sie dann auf z.B. einen USB Stick kopiert werden und auf einem anderen Rechner per Doppel-Klick installiert werden. Ein anschließender Start von Putty auf dem letzteren Rechner, sollte dann die alte Konfiguration aufweisen.

TIPP: Darüber hinaus sollte man nicht vergessen bei BackUps auch den eigenen .ssh Ordner extra zu sichern. Bei mir liegt der unter C:\Users\BenutzerName\.ssh